Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常染色质成环,倡导癌症发展
2021-11-08 05:03 来源:太原妇科医院
胃癌的其发展与载体抗原质内在无序区反之亦然(IDR)的DNA精神状态密切间有关。各种抗原质(有数酪氨酸系数、核仁调节剂和RNA紧密结合抗原)之中的IDR通过容器-游离剥离(LLPS)成型无所不在物,阻碍从酶器成型和刺激低剂量到DNA酪氨酸的无数生物全过程。
说是的容器-游离剥离(LLPS)是指融合两个不间有关DNADNA的全过程。该全过程暴发在酶核内,并能够成型很强各种物理特点的反之亦然,这些反之亦然可以倡导胃癌,例如急特质胃癌的暴发其发展。在急特质胃癌之中,微管抗原(NUP98或NUP214)的反复生殖酶走法显现出了一种精神状态融合体,它总是保持间有符微管抗原 IDR——谷氨酸和甘氨酸亚基(FG)的串联分散段落基因序列。然而,IDR如何造成了DNA错误转录和暴发尚不清楚。
2021年6月23日,西南新泽西学院教堂山分校 Gang Greg Wang 开发团队等 Nature 发表了月出版:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的学术研究论文。
该学术研究毫无疑问一般说来是胃癌成型的驱动因素,胃癌通过一般说来获得DNA以建立DEHP酪氨酸系数无所不在物,这同时减慢了它们的DNA组载体特质并在转化全过程之中诱导精神状态三维核仁结构的成型。该学术研究是较晚将一般说来与胃癌成型关联起来的学术研究之一。因为在其他恶特质之中掩蔽到了类似的DNA融合,文中之中阐明的组态也可以推论其他类型的胃癌。
NUP98–HOXA9举例来说两个抗原质基序和一个紧密结合基因序列。为了学术研究NUP98-IDR在胃癌暴发之中的一般来说,学术研究开发团队主要使用敲除了紧密结合基因序列的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。
他们辨认出,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种常用破坏间有-一般说来无所不在体的糖类)处理敏感。氢化的NUP98-IDR(N-IDR)抗原在体外成型容器体无所不在物。
为了进一步评估FG段落基因序列对无所不在物成型的分子量依赖特质和多价特质的重要特质,学术研究开发团队剥离出了富含不同比例FG段落基因序列的重组N-IDR抗原质。他们辨认出N-IDR举例来说38个或36个FG以分子量依赖特质的作法段落成型的容器体,那些举例来说27个或11个FG的却不能完成一般说来。指出NUP98–HOXA9之中的IDR以价依赖和分子量依赖的作法建立LLPS。
NUP98–HOXA9通过同源结构反之亦然与DNA紧密结合,造成了胃癌暴发全过程之中的DNA亢进。接下来,学术研究开发团队通过核仁免疫沉淀和数据处理测序来评估IDR介导的一般说来对NUP98–HOXA9核仁载体特质的阻碍。
%-, N-IDRWT/A9很强显着减慢的DNA组占有率,而与无监督聚类假定的峰值亚类也就是说。此外,窄而密集的的大减慢子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和胃癌间有关DNA非金属。
为了进一步评估IDR诱导的LLPS在不间有关的核仁载体之中的一般来说,他们利用了免疫学和医学的步骤,毫无疑问IDR介导的LLPS在减慢一些会酪氨酸系数载体特质方面的因果一般来说,在在的大减慢子样峰处见到的那些。指出IDR减慢融合体的DNA组紧密结合并且减慢靶DNA作用于。
为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS成型核仁反转的灵活性,学术研究开发团队生成了解读N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9酶的Hi-C图解,探究了DNA反转和镜像二者之间的移动性间有关特质。
为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C接触频率的阻碍,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9解读酶之中500个最浓烈的N-IDRWT/A9占据位点二者之间的间有互一般来说计算。%-,N-IDRWT/A9反转以基本上与CTCF也就是说的作法成型,与一般说来驱动组态间有符。另外,N-IDRWT/A9特异特质反转更进一步连接减慢子和靶DNA二者之间的连接,支持了融合酪氨酸系数的IDR通过一般说来在的大减慢子样小分子和肿瘤二者之间诱导DNA反转的观点。
综上所述,该学术研究辨认出NUP98–HOXA9之中富含的LLPS活特质IDR对胃癌的暴发和DEHPDNA解读程序的作用于至关重要。这些effect由IDR的灵活性介导:1)减慢酪氨酸系数与DNA组小分子的紧密结合;2)倡导减慢子和肿瘤位点二者之间的长距离反转。
该学术研究透过了一个DEHPDNA的法则特质证明,该DNA在转化全过程之中倡导LLPS驱动的酪氨酸系数紧密结合和3D核仁重组。由于含IDR的LLPS活特质分子与国际上的胃癌有关,该学术研究阐明的组态也可以推论其他类型的胃癌。
更早记事:
Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.
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